Jaden
Protagonista da série, Jaden é um duelista entusiástico com um deck baseado em Monstros HERÓI, além de ser conhecido por sua personalidade alegre e corajoso.
Alexis
Alexis Rhodes é uma duelista talentosa e uma das melhores alunas da Academia de Duelos de Duel Monsters, além de ser conhecida por sua beleza, inteligência e habilidades excepcionais de duelo. Seu deck principal consiste em cartas de Monstros Cibers.
Bastion
Bastion é conhecido por sua paixão pelo estudo e sua abordagem lógica para o duelo. Seu deck principal é focado em Monstros Dinossauros, demonstrando seu interesse pela ciência e história. Bastion é um amigo próximo de Jaden Yuki e outros protagonistas, embora ele tenda a se destacar mais pelo seu intelecto do que pela habilidade no duelo.
Chazz
Chazz Princeton é inicialmente retratado como um duelistas arrogante e autoconfiante, com uma personalidade competitiva e uma busca incessante pelo poder. Seu deck principal é baseado em Monstros Dragão, incluindo a carta emblemática "O Dragão Armado de Ra".
Chumley
Chumley é conhecido por seu amor pela culinária e seu deck, que inclui cartas de Monstros Máquina. Sua personalidade é descontraída e amigável, embora ele inicialmente enfrente desafios acadêmicos.
Crowler
Vellian Crowler é o professor de Duelos de Monstros da Academia de Duelos e possui uma personalidade competitiva e autoritária. Seu deck é baseado em Monstros Máquina, com destaque para os Monstros Antigos, como "Ancient Gear Golem"
Jesse
Jesse Anderson é um personagem carismático e amigável, possuindo uma forte conexão com a natureza. Seu deck é baseado em Cristais Bestiais, que reflete sua afinidade com a flora e fauna.
Syrus
Syrus Truesdale é conhecido por sua timidez e falta de confiança inicial, onde muitas das vezes é retratado como um jovem inseguro, que luta para encontrar sua voz. Seu deck principal é baseado em Robôs de Batalha, que reflete sua afinidade por máquinas e tecnologia.
Zane
Zane Truesdale é um personagem notável na série, onde é retratado como um duelistas altamente talentoso e focado em suas habilidades, inicialmente sendo um dos melhores alunos da Academia de Duelos. Zane usa um deck especializado em Monstros Cibers e tem uma personalidade séria e competitiva.
Yubel
Yubel é inicialmente introduzida como uma carta de Monstro, mas posteriormente se manifesta como uma entidade poderosa e misteriosa. Yubel é conhecida por sua natureza obscura e obsedante, muitas vezes ligada a sentimentos de solidão e ressentimento. Seu deck é centrado em cartas relacionadas à sua própria existência e poder, como "Yubel - O Monstro Final".